Анализ последовательности промышленно важных генов

Гомология между генами может быть идентифицирована с помощью выравнивания последовательностей, и это предположение становится еще более сильным, если воспринимать при множественном выравнивании группу организмов, представляющую два отдельных гена, и другую группу, представляющую слитые гены.

Введение в нанопоры

Нанопоры привлекли большое внимание из-за их способности действовать как секвенсоры одиночной молекулы ДНК в сочетании с надлежащим храповым ферментом и электроникой для мониторинга ионного тока . Несмотря на их биологическое значение, гораздо меньше работ по изучению молекул РНК. Как и ДНК, прямое секвенирование отдельных молекул РНК является очень важной темой. Кроме того, вторичные и третичные структуры, образованные относительно короткими фрагментами РНК, также имеют одинаковое биологическое значение. Нанопоры — это уникальные инструменты, которые, как было показано, чрезвычайно чувствительны к изменениям в последовательности, а также к структуре. В этой главе мы обсуждаем текущее состояние секвенирования РНК.а также структурное исследование с использованием как твердотельных, так и биологических нанопор.

Принцип измерения нанопор основан на быстрых измерениях флуктуаций ионов через отверстие наноразмерного размера. Поперечное сечение нанопоры в изолирующей мембране (не в масштабе) . Концентрированный раствор электролита (> 100 мМ) помещается с обеих сторон мембраны, так что единственный электрический контакт между камерами находится в нанопоре. Электрохимическое смещение, приложенное к мембране, вызывает перенос ионов через нанопору со скоростью, которая определяется размерами нанопор, поверхностным зарядом нанопор, приложенным напряжением, подвижностью ионов и вязкостью раствора. Как правило, для тонкой поры симметричной геометрии вольт-амперная характеристика является линейной. Применение постоянного смещения постоянного тока приводит к установившемуся току, который служит базовым измерением объема нанопор.